DNA-analyse frå Amerika - hjelp til tolking?

[Lars E. Øyane]

Frå ein slektning i Amerika med felles agnatisk opphav som mor mi har eg motteke ei lang lang liste med DNA-innførsler.  Overskriften av dokumentet lyder slik:

 

~~~~~~~~~~~~

 

# This data file generated by 23andMe at: Wed Jan 13 17:18:59 2021
#
# This file contains raw genotype data, including data that is not used in 23andMe reports.
# This data has undergone a general quality review however only a subset of markers have been
# individually validated for accuracy. As such, this data is suitable only for research,
# educational, and informational use and not for medical or other use.
#
# Below is a text version of your data.  Fields are TAB-separated
# Each line corresponds to a single SNP.  For each SNP, we provide its identifier
# (an rsid or an internal id), its location on the reference human genome, and the
# genotype call oriented with respect to the plus strand on the human reference sequence.
# We are using reference human assembly build 37 (also known as Annotation Release 104).
# Note that it is possible that data downloaded at different times may be different due to ongoing
# improvements in our ability to call genotypes. More information about these changes can be found at:
# https://you.23andme.com/p/70578f70fac27543/tools/data/download/
#
# More information on reference human assembly builds:
# https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_000001405.13/
#
# rsid    chromosome    position    genotype
rs548049170    1    69869    TT
rs9283150    1    565508    --
rs116587930    1    727841    GG
rs3131972    1    752721    GG
rs12184325    1    754105    CC
rs12567639    1    756268    AA
rs114525117    1    759036    GG
rs12124819    1    776546    AG
rs12127425    1    794332    GG
rs79373928    1    801536    TT
rs7538305    1    824398    AA
rs28444699    1    830181    AA
rs116452738    1    834830    GG
rs72631887    1    835092    TT
rs28678693    1    838665    TT
rs4970382    1    840753    CT
rs4475691    1    846808    CT
rs72631889    1    851390    GG
rs7537756    1    854250    GG
rs13302982    1    861808    GG
rs376747791    1    863130    AA

 

~~~~~~~~~~~~

 

Eg har her berre teke med dei første linjene - det må vera fleire tusen slike innførsler, men eg forstår ikkje bêret av dette!

 

Frå ein kjenning i Noreg som har ganske god peiling på FTDNA, har eg motteke følgjande kommentar:

 

«Det kan nok analyseres ved hjelp av et dataprogram, og det kan trolig hentes opp i andre Gen-programmer, slik som FTDNA, men dette er tydeligvis enkelte punkter i de autosomale genene, kromosom 1-22, pluss kanskje X-kromosomet.»

 

Eg er absolutt på «botn-nivå» når det gjeld å forstå slike analyser, so no vonar eg at einkvan eventuelt kan hjelpa meg vidare?  Eg oversender gjerne heile fili til dei som ønskjer det, om de tek kontakt pr. mail (lars@oyane.fr).

 

Eg takkar so mykje på førehand for alle gode tips!

[Anton Hagelee]

4 hours ago, Lars E. Øyane said:

Eg er absolutt på «botn-nivå» når det gjeld å forstå slike analyser, so no vonar eg at einkvan eventuelt kan hjelpa meg vidare?  Eg oversender gjerne heile fili til dei som ønskjer det, om de tek kontakt pr. mail (lars@oyane.fr).

 

 

Du kan lese her . 

 

https://www.norwaydna.no/?fbclid=IwAR1JeCVhePVfxb7lIrXvrix7B05AtOBex_-obC__JV_PoLzd8voMQVf1_Po

 

 Du kan diskutere med kunnskapsrike mennesker som

 

David Widerberg Howden

 

https://www.familytreedna.com/groups/norway/about/background

 

Også David er medlem av Brukernes eget forum.

 

 

 

Endret Januar 14, 2021 av Anton Hagelee

[Anton Hagelee]

Du har fått rå DNA-data.

 

The raw data are your genotype—the particular A's, C's, T's, and G's of your DNA—extracted from the sample you provided. These data are unique to you. Most companies caution that the raw data are only for research or education and are not suitable for medical purposes, such as diagnosing a disease.

 

The raw data provided by 23andMe is an advanced view of all your uninterpreted rawgenotype data, including data that is not used in 23andMe reports. This data has undergone a general quality review however only a subset of markers have been individually validated for accuracy.

 

https://www.geneheritage.com/blog/what-is-raw-dna-data.html

 

https://www.geneheritage.com/blog/how-use-raw-dna-data.html

 

 

 

Endret Januar 14, 2021 av Anton Hagelee

[David Widerberg Howden]

For å få noe som helst nytte av en slik råfil, så kjør verdiene gjennom denne: https://ytree.morleydna.com/ eller https://cladefinder.yseq.net/ da får du oppgitt Y-DNA gren, her er for mtDNA: https://dna.jameslick.com/mthap/ Råfilen kan også lastes opp til Familytreedna: https://www.familytreedna.com/autosomal-transfer , Myheritage og Gedmatch for å få treff basert på autosomalt-DNA (De 22 kromosomene som ikke er kjønnskromosomer X og Y).

Endret Januar 14, 2021 av David Widerberg Howden

[Anton Hagelee]

 

Jeg antar at rådataene er fra en Autosomal-test fra 23andMe.

 

Jeg er ikke en DNA-ekspert, men ville ikke Lars få mer informasjon fra en Y-DNA-test.

[Lars E. Øyane]

Innlegg #6:

 

Hjarteleg takk til Anton og David for spennande og nyttige innlegg!

 

No forstår eg litt betre forskjellen på desse testane, men er det naudsynt å gjera dette so komplisert?  Me er jo alle interesserte i å finna ut so mykje som mogeleg...  Nesten som alle dei ulike COVID 19 - vaksinane...

 

Eg har no skrive direkte til David med bøn om at han hjelper meg konkret med denne kjempestore fili og vonar han greier det...

 

Ein ny kjempetakk for all bistand!

[David Widerberg Howden]

1 time siden, Anton Hagelee skrev:

 

 

Jeg antar at rådataene er fra en Autosomal-test fra 23andMe.

 

Jeg er ikke en DNA-ekspert, men ville ikke Lars få mer informasjon fra en Y-DNA-test.

Så absolutt! Men i autosomale rådata fra både Ancestry, 23andme og Myheritage kan det finnes avlesninger av både Y og mtDNA som kan være nyttige. Men det som mangler er den dype analysen og treff med andre og uten noe å sammenligne med er det jo ikke alltid av så stor verdi. Men her er målet å finne Y-DNA til en farslinje som en av Lars sine aner har og når det sammenlignes med andre i Norgesprosjektet kan det bli interessant. (Men helt riktig at en egen Y-DNA test som regel har høyere verdi). 

31 minutter siden, Lars E. Øyane skrev:

Innlegg #6:

 

Hjarteleg takk til Anton og David for spennande og nyttige innlegg!

 

No forstår eg litt betre forskjellen på desse testane, men er det naudsynt å gjera dette so komplisert?  Me er jo alle interesserte i å finna ut so mykje som mogeleg...  Nesten som alle dei ulike COVID 19 - vaksinane...

 

Eg har no skrive direkte til David med bøn om at han hjelper meg konkret med denne kjempestore fili og vonar han greier det...

 

Ein ny kjempetakk for all bistand!

Ja, det er litt komplisert dette, Y og mtDNA er det egentlig kun Familytreedna som fokuserer på av de store selskapene, andre fokuserer kun på autosomalt-DNA, som tross alt er mer kommersielt salgbart, da man er omtrent garantert å finne noe slekt innen skriftlig tid og så nære som man kan komme (oppdraget er å finne hvordan de er i slekt). Man får som regel tusenvis av treff og det er jo gjerne litt mer spennende for mange enn de få man får på Y-DNA. I tillegg er det jo autosomalt-DNA som den såkalte "etnisitetstesten" er beregnet på. Jeg har allerede tatt en rask kikk på fila og sendt det jeg fant.